民進黨於3月2日召開中央執行委員大會（中執會），總統當選人蔡英文在會上表示，將在今年5月20日就任總統後繼續擔任民進黨主席。
民進黨上一次執政時，時任總統陳水扁曾以「黨政同步」原則推動修訂黨章，規定民進黨籍總統可在任期內兼任黨主席。此外，民進黨黨章13條、15條也規定，民進黨籍副總統、總統府秘書長、行政院長是該黨「當然中常委」，而民進黨籍總統府副秘書長、中央政府院長、副院長、秘書長、政務委員、部會正副首長等政務官則為「當然全國黨代表」。
而為了因應全民政府及行政中立的原則，此次中執會通過黨章研修草案，擬於4月9日召開臨時全代會，移除政府要員擔任民進黨當然中常委、當然全國黨代表的相關規定。
但有中執委提出，若這一修正案獲得通過，未來民進黨中常會中將缺乏行政系統代表，因此紛紛「勸進」蔡英文兼任黨主席。
「多位中執委認為，總統兼任黨主席是為落實政見、加強黨政協調，未來走向黨政同步。 」民進黨中常委、黨內規章研修小組召集人陳明文表示。
據中央社引述媒體報導，蔡英文本不想兼任黨主席，但為避免選黨主席引發黨內鬥爭，以及近來部分民進黨立委推出爭議法案（如總統交接條例、廢除國父遺像等）與蔡英文施政策略不同步，在考量黨政協調和落實競選政綱，蔡英文最終同意兼任黨主席職務。
另據風傳媒報導，蔡英文原本希望由高雄市長陳菊來接掌民進黨主席，但陳菊為確保市長一職能順利交棒，沒有意願擔任黨主席。
國民黨政策會執行長賴士葆對蔡英文的決定表示「尊重」。但他認為，黨主席必須捍衛黨的利益，若黨的利益與全民利益有衝突，就無法做到「全民總統」。他還指出，前總統陳水扁、總統馬英九兼任黨主席都「做得很糟」，提醒蔡英文不要犯前人的錯，把立法院當成行政部門的橡皮圖章。
昔日曾批評馬英九兼任國民黨主席是「毀憲亂政」的前民進黨主席謝長廷，此次則對蔡英文的兼任表示支持。他指出，民進黨籍立法院長蘇嘉全已退出黨務，且行政要職擔任當然中常委、黨代表的規定也都擬被刪除，這些措施都可避免總統未來集權或擴權。
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