根據歐盟與土耳其上月就解決難民問題達成的協議，在希臘申請避難失敗的難民於4月4日起已經被陸續遣返回土耳其。
目前有約5萬名非法入境的難民滯留希臘，但根據相關協議，只有在3月20日之後經土耳其偷渡到希臘且不符合收容資格的難民，才會被遣返回土耳其，估計涉及難民數目約為4000人左右。
在4日到6日三天內，預計有750名難民將陸續抵達土耳其迪基利港（Dikili）。歐盟邊界管理局（Frontex）表示，當地時間4日上午共有136名難民離開希臘被送往土耳其。
敘利亞等地的難民大多先到達土耳其，然後再橫渡愛琴海後進入希臘，之後繼續前往歐洲其他國家。為緩解難民大量湧入歐洲，歐盟與土耳其達成協議：土耳其每接收一名從希臘遣返的難民，歐盟就會從土耳其接收一名符合資格的難民。
為了獲得土耳其的支持，歐盟還須滿足土耳其的一系列要求，包括向土耳其提供額外30億歐元的支援款項（相關款項至今累積達60億歐元）、加快為土耳其公民提供神根區免簽證待遇，以及加速審批土耳其加入歐盟的申請等。
「遣返作業真不知該如何進行，這是前所未見的工作，而且法律問題千頭萬緒。」希臘難民協調部門發言人基里齊斯（Giorgos Kyritsis）表示。
執行遣返任務的歐盟邊界管理局表示，已經包租兩艘船用於難民移送，但遣返工作需要2300人，目前到位者不及十分之一。而土耳其當局仍未公布收容難民的具體安排，包括接收難民人數上限以及如何安置等事項。此外，在協議開始實施前的2日到3日上午，仍有514名難民抵達希臘。
遣返行動也遭到了難民的抵抗。希臘希俄斯島（Chios）有多達800名難民於2日逃出拘留中心；在希臘和馬其頓接壤的邊境小鎮伊多梅尼（Idomeni）的臨時難民營則有逾200人不滿遣返安排，於3日佔領連接兩國的高速公路抗議，要求歐洲各國開放邊境，允許他們前往歐洲中部及北部。
而在同時，土耳其和希臘均出現反難民示威。伊多梅尼當地居民發起反難民示威，堵塞了連接難民營和高速公路的大橋。反難民示威者不滿等候過境到馬其頓的難民在當地設營破壞農地，還有居民投訴難民闖入其住所；土耳其港口城市迪基利則有約500名民眾示威，反對政府計劃在當地設置難民營收容被遣返的難民。當地居民擔心興建難民營將損害經濟和旅遊，並帶來安全問題。
國際特赦組織（Amnesty International）指出，歐盟與土耳其達成的協議不如表面看起來那麼美好，此協議有可能造成「災難性的連鎖反應」。根據該組織的調查，土耳其疑似在過去幾週強行將難民遣返回敘利亞，因此這些從希臘送回的難民可能會遭受同樣的命運。
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