與一般的航空公司不同，華航高階主管的任命須受政府節制，事實上華航本來就是負有階段性任務的公司，1993華航首度上市股票標誌民營化的開始，然而目前仍然處於過渡階段。
比如，最近華航罷工事件使孫洪祥董事長下台，何煖軒接任董座就是林全內閣授意的。
華航與政府的關係
國民黨撤退來台時，國內只有民航空運公司營運飛航事務，因為其為外國人創辦的民營公司，政府基於「空防根植於民航」的概念，決定創辦官方的航空公司來主持大局。後來民航空運公司在六零年代接連發生重大事故，在1975結束營運，華航獨佔國內航務直至1991長榮航空啓航。
1993年華航股票上市，政府沒有持有任何股票，法律上來看華航是家私人企業，然而華航有70%的股權由「財團法人中華航空事業發展基金會」掌控，而交通部是基金會的主管單位，因而交通部可以透過董會事會操控華航人事。
(圖片取自維基百科)
那些年 揹國旗的時光
原本華航飛機機身上塗有國旗，在兩岸關係緊張時華航上的國旗無異於挑釁中共，於是在中共的壓迫下使得加拿大與澳洲航線斷航，為了恢復航線，華航另外創辦華信子公司接手加、澳兩國航線。
1993年華航上市，逐漸走向民營化，為了避免中共在國際上的打壓，將公司象徵改為潑墨畫的梅花，以國花代替國旗。此一轉變也被解讀為國營邁向民營的轉折點。
出將入相的華航董座
因為華航負有的使命，也是極重要的航運公司，政府委派的高階主管幾乎都是經歷豐富、成績斐然的大材。
舉例來看，千禧年的董座是中華民國飛官傳奇老將李雲寧；魏幸雄，華航首位本省藉總經理，1971進入華航，歷任財務、客運、貨運等單位主管及外派各洲主事，於2005與2008年兩度擔任董座；2011年的董座張家祝，學歷高，政界歷任交通部常務次長、交通部民用航空局局長、中華郵政公司董事長。
而甫辭職的孫洪祥董座，1970年就進入華航，從基層開始，歷練紥實，曾被委派國華航空與華信航空救火，因為能力出眾被復興航空挖角，擔任復興航空總經理期間帶領公司轉虧為盈。
退休的華航董座，除非年事已高，通常也會有不錯的發展，比如2004年的華航董座離職後又接任許多重要職位，今年傳出有望出任中鋼董座；而2011年的董座張家祝離開華航後在2013年接任經濟部長，更上一層樓。
可以說，華航是國家磨練人材、安插人事的重要機構之一。
政爭的影響
既為如此重要的「政府組織」，華航董座的安排有時也會謠傳與藍綠政爭有所關聯。
2008年馬英九上台，趙國帥被拔董座就被外界聯想是否與其親綠的色彩有關。
而更早前，2000年政黨輪替時，宗才怡空降華航總經埋，謠傳滿天飛，指陳水扁要掌控華航人事。而華航董事長李雲寧在2004年總統大選在即的敏感時刻，外界也謠傳陳水扁政府會換掉李讓宗才怡接手。(但最後留任)
再怎麼說，華航仍是台灣最重要的航空公司，加上與官方「藕斷絲連」的關係，可能華航永遠不可能成為一個純民營的公司。
(首圖為何煖軒董事長 圖片取自維基百科)
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