我國與菲律賓，在五號簽署「漁業事務執法合作協定」，事前並未對外公布，引發外界質疑是否「讓利」，目前就雙方合作協定有下列幾項:
1 雙方執法避免使用暴力或不必要武力。
2 經濟海域重疊區域內，雙方對可能非法捕魚另一國籍漁船執法，須提前一小時通報彼此漁政、海巡機關與駐外館處。
3 倘漁船確定違法而遭逮捕，該漁船提出適當保證書或其他擔保，或支付符合逮捕方法律之罰鍰後，應於三日內釋放。
目前協議是針對，兩國漁船面臨的衝突，事前預防，進行作業前溝通處理，以和平處理為前提，保障雙方漁民安全。不過並沒有提到，各自監管海域範圍，由於我國和菲律賓各有立場，所以預定在明年再召開第2次的技術工作小組會議，持續磋商。台灣漁民被菲國海軍槍擊事件(廣大興案)至今，簽署台菲漁業協定，已經算有很大進展，以下是各界看法。
廣大興受害者家屬:根本是敷衍
家屬洪慈綪表示，漁業談判是廣大星案後，洪家與菲方和解條件之一，重點在漁權、漁區以及執法範圍，沒談捕魚界線，談執法前不使用武力、互相通報等，根本是在敷衍台灣人。
台灣漁民:怕捕不到鮪魚
雖然簽訂漁業協定，降低擦槍走火的風險，讓漁民很振奮，另一方面卻也擔心如果進一步擬定明確的作業區域，我方漁民可能捕不到鮪魚。像是台灣巴士海峽，就與菲國北方的巴林坦海峽重疊，這區塊漁獲豐富黑鮪魚、黃鰭鮪很多，越靠菲律賓，漁獲越多，如果明訂區域，我國漁民怕是捕不到鮪魚。
學者說法:自我限縮24浬外，增談判困擾
台大法律系教授姜皇池表示，台菲雙方簽訂協議，但是菲國主張我方不能到鄰接區(菲國領海基線向外12至24浬海域)捕魚，他直言我方自我限縮，會增加談辦困擾。
在台菲兩國還沒畫出明確範圍的重疊海域前，根本沒理由禁止對方漁船作業，我國為何要讓步?以台日漁協做參考，當初雙方只排除釣魚台周遭12海浬，台菲為何不比照辦理?
農委會
農委會主委陳保基表示，「台菲漁業執法合作協定」已簽署約3週了，在亞太經濟合作會議(APEC)，經濟領袖閉門期間簽訂，為了避免南海事端干擾，所以沒有對外公開，直到近期才對外公布。
困難點:
菲律賓單方依據1958年早期的聯合國海洋法公約內容，主張在「鄰接區」水域上可登船檢驗台灣漁船。
「領海」從領海基線往外推算12浬，台灣漁船在領海須掛國旗，不可捕魚；「經濟海域」則是從領海基線往外推算12到188浬間水域，可以捕魚。
菲國主張的「鄰接區」是從領海基線往外推算12到24浬，與國際現行的「經濟水域」重疊，卻主張不可以捕魚，兩國對此仍有爭議，將是未來討論重點。