3月3日，歐洲理事會主席圖斯克（Donald Tusk）訪問希臘與土耳其，與當地官員探討如何處理難民危機。他在與希臘總理齊普拉斯（Alexis Tsipras）會談後呼籲，所有潛在的「非法經濟移民」不要到歐洲來，希望他們不要相信蛇頭，不要拿生命和金錢冒險；此外，他還與土耳其接近達成一項至關重要的協議，根據協議，滯留在希臘的非敘利亞難民將被遣返回土耳其。
「不要拿你的生命和金錢冒險，你會一無所獲。」歐洲理事會主席圖斯克表示。
隨著馬其頓在2月23日的巴爾幹十國會議後關閉邊境，已經有約1萬難民滯留在希臘與馬其頓邊境。此後曾有難民試圖「衝關」，但被馬其頓警方以催淚彈驅散。3月3日當日，部分難民還堵塞了希臘與馬其頓之間的一條鐵路以示抗議。半島電視台駐當地記者指，原有的難民營已經無法容納大批滯留的難民，有難民開始就地搭帳篷，甚至進入樹林生火來熬過寒冷的夜晚。
北部邊境的關閉加劇了希臘的難民負擔，導致希臘全國上下滯留了超過2.5萬難民。在與圖斯克的會談中，希臘總理齊普拉斯再次重申希望歐盟各國分攤難民責任。圖斯克則表示，歐洲各國不應進行單邊行動，而要在難民潮問題上加強合作，並稱會在3月7日的歐盟峰會上重申這一要求。而他對經濟移民的勸阻，則是歐盟高層首次公開拒絕此類移民，此前巴爾幹10國都已決定拒絕經濟移民及阿富汗移民。
在土耳其，圖斯克則與該國總理達武特奧盧（Ahmet Davutoglu）進行會談。達武特奧盧暗示，土耳其可以接受歐盟系統化地遣返所有非敘利亞難民，並加大力度打擊人口走私，不過他也重申了土耳其希望加入歐盟以及土耳其公民免簽進入歐盟的訴求。
數量龐大的難民大多先經土耳其進入地中海，然後抵達希臘，進而北上歐洲尋求庇護。土耳其官方強調，他們已經在2016年阻止了2.5萬移民進入歐洲。但與此同時，國際移民組織表示還是有13萬難民在今年到達了希臘。
德國總理默克爾與歐盟自2015年以來就多次敦促土耳其加大力度阻止難民，此次土耳其與歐盟的協議雖然尚未最終達成，但也是雙方合作解決難民問題的重要進展。
2015年11月底，歐盟曾承諾在未來兩年中發放30億歐元的援助金給土耳其，用以安置難民，且會在2016年10月起對土耳其公民免簽。今年，歐盟則表示希望土耳其能盡其最大努力，將每天到達希臘的難民人數減少到1000人以下。
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