（示意圖/取自pixabay）
在分秒必爭的抗疫競賽中，速度越快越好。
在這場抗疫競賽的背後，超級電腦成為了加速器。
據Venture beat報導，IBM加入了由美國政府主導成立的COVID-19高性能運算聯盟（High Performance Computing,HPC），幫助研究人員部署預測模型，分析新冠疫情的發展過程，加速推進病毒治療進程。
面對病毒（包括COVID-19病毒）這類新生化合物，研究人員會在實驗室中，培養微生物並觀察其對引入的新生化合物的反應，逐漸縮小潛在變量的範圍。
不過，單獨的變量可能包含著數百萬甚至數十億個數據需要模擬，僅依賴研究人員的觀察，將是個巨大的挑戰。
目前，全球正處於對抗疫情的非常時期。數據顯示，全球新冠病例確診已超過33萬人，且全球有許多個國家都處於疫情暴發期，確診數量還在不斷攀升。
在這場抗疫競賽中，時間是獲勝的重要因素。對病毒的瞭解多一點，對疫苗的研究更近一步，新冠病毒的威脅就少一分。
IBM研究總監Dario Gil在部落格中表示，在流行病學、生物資訊學和分子建模的實驗中需要大量運算，如果手動進行，實驗需要數年才能完成；如果在速度較慢的傳統運算平台上操作，也需要數個月的時間，而超級電腦高性能的運算系統，能夠快速解決這一問題。
據悉，IBM此次參與COVID-19研究的是Summit超級電腦，是目前世界上最強大的超級電腦。它由4608台運算伺服器組成，每個伺服器包含2個22核Power9處理器，6個Nvidia Volta V100 GPU。另外，Summit還擁有超過10PB的儲存器，其運算能力最高可達200PFlops。
在加入COVID-19高性能運算聯盟之前，Summit在新冠疫情研究中就已取得了突破。美國橡樹嶺國家實驗室（Oak Ridge National Laboratory）研究人員表示，其團隊借助Summit，尋找到可以對抗COVID-19最有效的現有藥物。
經查詢，其研究成果已發表至《ChemRxiv》 雜誌，論文題為「Repurposing Therapeutics for COVID-19: Supercomputer-Based Docking to the SARS-CoV-2 Viral Spike Protein and Viral Spike Protein-Human ACE2 Interface」。
在此項研究中，研究人員從8000多種化合物入手，借助Summit的算法，尋找可以與蛋白質結合並阻止病毒發揮作用的藥物。
初步結果顯示，目前Summit已篩選出77種化合物，能夠與Spike蛋白結合，阻止病毒表面的分子與人類細胞上的血管收縮素轉化酶2（angiotensin-converting enzyme 2，ACE2） 受體相連。
值得說明的是，儘管Summit運算能夠在病毒研究方面發揮作用，但並不能夠自行設計出一種治療方法，其臨床分析過程並不理想，還需醫療機構對已篩選出的化合物，進行評估、測試才能用於臨床試驗。
另外，Summit輔助研究的方法，僅是幫助緩解COVID-19的症狀並提高存活率，而非疫苗研製。不過，在COVID-19高性能運算聯盟中，除了IBM，還包括了Google、微軟、美國能源部、壬色列理工學院等其他公司及學術機構；而這些機構的運算能力，同樣在病毒研究中發揮著作用。
亞馬遜AWS部門啓動一項計劃，為研究機構和公司提供技術支持，推進COVID-19在診斷、治療、疫苗等方面的研究。同樣，微軟也表示，將透過擴展對Azure和高性能運算能力的訪問，與科學家合作，為對抗COVID-19的研究人員，提供所需工具。
壬色列理工學院，將其人工智慧多處理優化系統電腦（AiMOS）部署在壬色列運算創新中心，該學院表示正與研究機構接觸，支持與COVID-19有關的研究。
越來越多的力量加入了抗疫競速之中，面對新冠病毒這一全人類的共同敵人，多方合力，抗疫成效終會呈現「1+1>2」。
本文為雷鋒網授權刊登，原文標題為「IBM 超級計算機篩選出 77 種抗病毒化合物，成抗疫新力量」