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「超越藍綠」提案與連署人幾乎是藍綠各半的《宗教基本法》，本來排定要在今天付委審查，但因為眾多民眾、團體反對，終於撤案。
聯名反對《宗教基本法》的團體達50多個，為何《宗教基本法》會造成這麼大的反對聲浪呢？因為該法若通過，將使宗教事業可依法開很多後門，凌駕在憲法、民法、司法之上。
主管機關不得介入宗教事務
草案中說明，聖俗分離原則（The principle ofseparation of religion and secularism）是憲法上處理宗教事務的基本精神，法案參考日本《宗教法人法》，希望處理宗教事務的主管機關基於保障宗教信仰自由，應尊重宗教法人或其他宗教團體的傳統、特殊性及自主性，「不得介入宗教教務」。
法院不得干涉宗教法人的人事任免
草案中又寫道，有關宗教法人或其他宗教團體的信仰、教制等教務，法院不得調解與干涉，也「不得干涉其組織及人事任免」。
國民基本教育應將宗教知識教育列入課程
另外，草案要求國民基本教育將宗教知識列入課程，培養學生關於宗教的知識，以及宗教中立、宗教寬容的態度和「一般性的宗教情操」，並使之重視宗教在社會生活中的地位。
私立學校可以從事特定宗教的教育
對教育的要求中，《宗教基本法》希望開放私立學校從事特定宗教的教育及活動，唯不得強迫教師、職員或學生參加。
宗教自主權無限上綱
《宗教基本法》中第十三條寫道，民法及社團與財團法人規定不適用於宗教團體，且「國家不得要求宗教團體遵守民主與公開之原則」。
可以不遵守民法特留分制度
《宗教基本法》中第二十條寫道，宗教師死亡，其遺產依其遺矚定之，民法規定不適用。也就是說，若此法通過，「宗教師的遺產可以不遵守民法的特留分制度」，完全依照死者生前的財產分配意願。
可依法財務不透明
《宗教基本法》中第二十五條寫道，主管機關不得將宗教團體的財產與法務清冊、財務報表或其他資訊，提供任何人。若此法通過，「宗教團體將可依法不公開其財務紀錄」，成為洗錢的溫床。
因為種種凌駕法治精神、法律制度的條例，《宗教基本法》遭到民間、政治人物的諸多攻擊。如果這個《宗教基本法》草案通過，未來台灣恐怕會變成一個宗教大於司法的國家。